Khi Ruka còn nhỏ, cô thấy một bóng ma trong nước của khu hồ cá thủy cung nơi bố cô làm việc. Giờ đây, cô cảm giác mình có mối liên hệ nào đó với hồ thủy cung ấy và hai cậu bé bí ẩn mà cô gặp. Họ là Umi và Sora - hai đứa trẻ được những con bò biển nuôi nấng. Giống như Ruka, họ cũng nghe được âm thanh kì lạ kêu gọi họ từ vùng đại dương kia.
Trong khi đó, bố của Ruka và những người lớn khác không quan tâm lắm đến lũ trẻ, vì họ đang vướn vào một hiện tượng bí ẩn - hàng loạt cá trên đại dương khắp thế giới đột ngột biến mất.